Была такая же проблема что у тебя, мозоли были ещё страшнее.
Что помогло:
- Специальные беговые носки, продаются в спортивных магазинах. Уменьшают трение во время тренировки.
- Купил новые бутсы. В старых бутсах стельки были протёрты, грубые и создавали эффект наждачки
Можешь ещё попробовать перед тренировкой брызгать ноги Cutasept/Chemisept. Уменьшают потливость + дизинфекция.